テイクアウトを利用中に緊急で注文受付を停止することはできますか？

できます。

テイクアウト・小売モードを有効にすると[クイック編集]に[外部注文を緊急停止する]ボタンが表示されます。
[外部注文を緊急停止する]ボタンをタップするとテイクアウト注文のみ停止されます。