特定のお客様だけに特別メニュー（社食や割引商品など）を出すことはできますか？

できます。

【管理画面での設定】
① [店舗管理] – [注文QR一覧]をタップし、設定したい[注文QR名]をタップします

② [注文QRオプション設定]の[オプションを設定する]をタップします

③ 通常メニュー用の注文QRには、[この注文QRで表示させるカテゴリ]に通常メニューで表示させるカテゴリ全てにチェックをいれます
（この例では[特別メニュー]以外を表示しています）

④ 特別メニュー用の注文QRには、[この注文QRで表示させるカテゴリ]に特別メニューを含めたカテゴリ全てにチェックを入れます
（この例では[特別メニュー]を含めたすべてのメニューを表示しています）

以上で一部の注文QRに特別メニューを表示させることができます。